Краткият отговор е: да. Зоните по „Натура 2000“ в България са определяни с активното участие на зелените неправителствени организации. Те са с толкова голям обхват, че в тях попадат трасетата на почти всички големи инфраструктурни обекти от пътната мрежа, включително и дългоочакваните тунели под Петрохан и Шипка.
